仔豬出生時(shí)，腸道處于微生物真空狀態(tài)，但這一狀態(tài)很快被打破。研究表明：出生后3小時(shí)內(nèi)，80%以上的菌種已開始定植，其微生物主要來源于母體產(chǎn)道、糞便、地面周圍環(huán)境等。隨著時(shí)間的推移，腸道內(nèi)的需氧菌和兼性厭氧菌數(shù)量迅速增加，12小時(shí)內(nèi)，結(jié)腸后段菌群數(shù)量可達(dá)到109CFU/g。仔豬出生24小時(shí)內(nèi)，空腸、回腸、盲腸和直腸就迎來了分歧桿菌、大腸桿菌、乳酸桿菌、消化球菌、類桿菌、腸球菌、小梭菌、真桿菌和酵母菌等多種細(xì)菌的定植。在出生后的48小時(shí)內(nèi)，由于母乳的影響，厭氧菌(有益菌)迅速嶄露頭角，逐步形成優(yōu)勢(shì)菌群（腸道中90%以上的菌種都是厭氧菌）。出生后第一周內(nèi)，菌群中乳酸桿菌，鏈球菌成為優(yōu)勢(shì)菌群，內(nèi)容物會(huì)保持107-109CFU/g的數(shù)量。并且這種優(yōu)勢(shì)在整個(gè)哺乳期得以延續(xù)。這一階段菌群的快速建立，為仔豬腸道微生態(tài)系統(tǒng)奠定了初步基礎(chǔ)。仔豬出生后第一周是腸道菌群從無到有的關(guān)鍵階段，快速的形成腸道有益菌優(yōu)勢(shì)，是有助于減少產(chǎn)房細(xì)菌性腹瀉的方式，比如仔豬黃白痢。

    在仔豬哺乳期，隨著穩(wěn)定的母乳持續(xù)攝入，腸道菌群進(jìn)入相對(duì)穩(wěn)定的發(fā)展階段。在這一階段，乳酸桿菌和鏈球菌憑借對(duì)母乳底物的高度適應(yīng)性，在菌群生態(tài)位中優(yōu)勢(shì)穩(wěn)坐，它們能夠有效利用母乳中的乳糖等成分進(jìn)行生長繁殖。這種穩(wěn)定的菌群結(jié)構(gòu)有助于仔豬更好地吸收母乳中的營養(yǎng)成分，促進(jìn)其生長發(fā)育。同時(shí)能夠增強(qiáng)仔豬的免疫力，抵御外界病原菌的入侵。

    斷奶階段堪稱仔豬腸道菌群變化的關(guān)鍵轉(zhuǎn)折點(diǎn)，這一過程通常需要2到3周的時(shí)間，腸道菌群才能逐漸恢復(fù)穩(wěn)定。斷奶意味著仔豬從依賴母乳轉(zhuǎn)變?yōu)橥耆揽抗腆w飼料生存。固體飼料的能量物質(zhì)主要以碳水化合物為主，與母乳中以脂肪為主的能量物質(zhì)相比，其成分更加復(fù)雜。斷奶的仔豬面臨食欲下降，同時(shí)仔豬還遭遇斷奶、混群、環(huán)境改變等多重應(yīng)激影響，致使腸道結(jié)構(gòu)出現(xiàn)異常，菌群穩(wěn)定性被徹底打破。在斷奶后的第一周，腸道菌群的結(jié)構(gòu)最為不穩(wěn)定，細(xì)菌的活力也大大降低。研究表明，斷奶應(yīng)激會(huì)導(dǎo)致小腸中的乳酸桿菌數(shù)量減少100倍，而大腸桿菌的數(shù)量則增加了50倍。腸道pH值升高（>5.5），消化酶活性降低。同時(shí)，在這一階段還出現(xiàn)G-菌（如大腸桿菌）對(duì)G+菌（如乳酸菌）的排斥現(xiàn)象。盡管G+菌最終在成年豬腸道內(nèi)占據(jù)重要地位，但在斷奶初期，這種菌群間的激烈變動(dòng)給仔豬腸道健康帶來了極大挑戰(zhàn)，往往容易引發(fā)腹瀉等疾病，造成腸道粘膜損傷，影響消化吸收和生長發(fā)育。因此，在仔豬斷奶過渡期，通常會(huì)在仔豬飼料中或者養(yǎng)殖過程中使用一些保健產(chǎn)品來調(diào)節(jié)腸道健康，比如酸化劑、微生態(tài)制劑、植物精油和酶制劑等，降低仔豬菌群動(dòng)蕩給仔豬生長帶來的影響。